生物学

Phylogenetic Comparative Methods: Learning From Trees

Luke J. Harmon

英語原題: Phylogenetic Comparative Methods: Learning From Trees

系統樹と統計モデルで形質進化と多様化を調べる無料教材。共通祖先による依存と、模型、樹、標本化それぞれの不確実性を考える。

前提知識

進化入門、確率、回帰、基本的な模型当てはめが必要。対数と尤度、R、系統樹データに慣れているとよい。

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学部上級生と大学院生の比較進化解析向け。樹を関係図として見るだけでなく統計モデルへ組み込む。

進化入門、確率、回帰、基本的な模型当てはめが必要。対数と尤度、R、系統樹データに慣れているとよい。

統計、ブラウン運動、多変量形質、代替模型、離散形質、生滅過程、多様化率を扱う。

小さな樹で種間の非独立性を説明し、既知模型を模擬してから実データへ当てる。パラメータと仮定を書き、別の樹や標本化で安定性を比較する。

著者の全文とPDFは2019年付の本文とCC BY条件を示す。後の共著Phylogenetic Comparative Methods in Rとは別作品。未確認の紙版ISBNを付さない。