生物學

Phylogenetic Comparative Methods: Learning From Trees

Luke J. Harmon

英文原名: Phylogenetic Comparative Methods: Learning From Trees

免費演化比較方法教材,用系統發育樹和統計模型研究性狀演變與多樣化,幫助讀者理解共同祖先造成的依賴及模型、樹和抽樣的不確定性。

需要的基礎

需演化導論、機率、迴歸與基本模型擬合,熟悉對數和似然更好;計算練習需R及樹資料。

出版年份
2019
難度等級
中級
學術層次
大學部
evolutionary biologyphylogeneticscomparative methods

01 / 導讀

導讀

適合誰

適合高年級與研究生比較演化分析,學會把樹納入統計模型而非僅當關系圖。

需要的基礎

需演化導論、機率、迴歸與基本模型擬合,熟悉對數和似然更好;計算練習需R及樹資料。

涵蓋內容

從統計建模進入布朗運動、多元性狀與替代模型,再講離散性狀、生滅過程和多樣化率。

如何使用

先用小樹解釋物種並非獨立,模擬已知模型再擬合資料;記錄引數含義,比較替代過程,在多棵合理樹與抽樣方案下檢查穩定性。

版本與來源

作者完整網頁和PDF含2019日期文字和CC BY條件。與後來合著的Phylogenetic Comparative Methods in R不同,未套未經版本確認的紙本ISBN。

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