生物学

Modern Statistics for Modern Biology

Susan Holmes; Wolfgang Huber

英語原題: Modern Statistics for Modern Biology

実際の生物データを使い、生成モデル、可視化、再現可能なR解析を結ぶ公開統計教材。統計の基礎からモデル選択と不確実性の説明へ進む。

前提知識

学部の確率統計、線形代数とRの使用経験が必要。多変量解析や一般化線形モデルの前に分布、検定、行列表記を復習する。

出版年
2019
難易度レベル
中級
学術レベル
大学院
biostatisticsRbiological data analysis

01 / 読書ガイド

読書ガイド

対象読者

大学院生と十分な基礎を持つ学部上級生向け。単純な検定から進み、生物学的問いと測定構造に合うモデルを考える。

前提知識

学部の確率統計、線形代数とRの使用経験が必要。多変量解析や一般化線形モデルの前に分布、検定、行列表記を復習する。

扱う内容

生成モデル、可視化、混合、クラスタリング、検定、多変量解析、計数、一般化線形モデル、ネットワーク、木、画像、教師あり学習、実験計画を扱う。

使い方

まず付属データの解析を再現する。観察単位、標本化、目標量を書き、小さな模擬データを生成する。残差と別の解析を比べ、前処理と依存ソフトの版をスクリプトに残す。

版と出典

著者の公開全文はCambridge University Pressの2019年刊とISBN 9781108705295を示す。オンラインのコードは独立更新され、CC BY-NC-SAで提供される。

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