生物學

Computational Genomics with R

Altuna Akalin

英文原名: Computational Genomics with R

完整計算基因組教材,把基因組生物學、R、統計與高通量測量的可重複分析整合起來,適合跨專業讀者按已有背景選擇學習起點。

需要的基礎

基礎分子生物學與統計有幫助,但書中按背景提供不同起點:生物讀者可先學R,計算背景讀者應先補基因組組織、調控與實驗測量。

出版年份
2020
難度等級
中級
學術層次
大學部
computational genomicsRgenomic data analysis

01 / 導讀

導讀

適合誰

適合從生物、醫學或定量學科進入基因組資料分析的高年級本科及研究生初期。作者明確考慮不同背景,幫助把計算程式聯絡到產生資料的檢測和生物問題。

需要的基礎

基礎分子生物學與統計有幫助,但書中按背景提供不同起點:生物讀者可先學R,計算背景讀者應先補基因組組織、調控與實驗測量。

涵蓋內容

由基因組生物學、高通量技術與R基礎進入資料處理、統計探索和基因組分析流程,例子覆蓋常見測量。計算與解釋並重,工具圍繞科學任務組織,不是互不相連的命令集合。

如何使用

選小資料,執行前記錄檢測方式、實驗單位、生物比較與變異來源;保留原始輸入,用指令碼記錄轉換。擬合前檢查質量和樣本關係,改變過濾或歸一化時說明假設變化並比較後果。重現例子後,再列遷移到另一實驗需要的檢查。

版本與來源

作者完整線上書署2020年9月30日,線上正文CC BY-NC-SA 4.0,軟體與資料另核條件。本次採用完整閱讀版而非出版社預覽;軟體包升級可能需對例子作小範圍調整,仍應保留分析邏輯。

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